三度目の世界大戦により、人類は一掃され、後には荒れた大地と文明の残骸だけが残った。それから200年――。人間の少女?ルゥは、ギアのゼットと穏やかな日々を送っていた。そんなある日、謎のギア?クロムが現れ、奇妙な3人暮らしが始まる。だが、狂機（インセイン）との遭遇により彼女の生きる道は一変する…!!